胡宇轩，“华山学者”特聘教授，博士生导师

    主持国家级青年人才项目、教育部中央高校青年教师科研创新能力支持项目

    研究方向：生物医学数据挖掘、细胞通讯与组织架构、单细胞与空间组学

    2026年拟招收多名博士生、硕士生、本科生研究助理

    主要从事“细胞交互智能解析与数字器官构建”等计算机与生命医学交叉研究，为癌症靶向/免疫（联合）疗法研发提供算法工具。研究成果以第一或通讯（含共同）作者发表于Nature/Science子刊《Nature Methods》(2024)、《Science Advances》(2021)、《Nature Communications》(2019)，以及领域著名期刊《Advanced Science》(2024)。指导博士生/硕士生发表Nature子刊《Nature Commmunications》(2026)、《PLoS Computational Biology》(2026)。其中，

（1）CytoCommunity算法：入选《Nature Methods》主页4篇精选（Featured）文章之一；是首个对单细胞空间图谱可以同时做无监督和弱监督学习的计算工具，能够在可变空间尺度上发现条件特异性的细胞邻域及其协作模式，为解析肿瘤-免疫互作机制提供分析工具；是西电首次以第一单位在“方法学”顶级期刊《Nature Methods》发表论文。

（2）HRCHY-CytoCommunity算法：实现组织空间结构的精细层级划分，定义组织区室（Tissue Compartment）和细胞邻域（Cellular Neighborhood）层级结构，为解析“细胞社会”提供算法工具。

（3）CytoTalk算法：被国际同行评价为“细胞通讯分析”代表性方法之一，入选国际顶级综述期刊《Nature Review Genetics》单细胞数据分析专家推荐方法；是西电首次以第一单位在Science子刊《Science Advances》发表论文。

（4）Driver2Comm算法：首次提出Intrinsic-Extrinsic (IE) pathway概念，将癌症驱动基因与肿瘤微环境细胞间通讯事件关联起来，为理解肿瘤如何作为一个复杂生态系统提供新视角，并为“靶向-免疫”联合疗法提供了潜在线索。

（5）OptiCon算法：实现癌症联合疗法靶标的从头识别，已在美国费城儿童医院预临床研究中获得成果转化应用。

    获ACM SIGBIO China分会新星奖（每年各领域仅2人获奖）、校级优秀教师荣誉称号等。

    完整论文列表详见https://scholar.google.com/citations?user=SWlJrycAAAAJ&hl=zh-CN，算法实现及软件见GitHub主页https://github.com/huBioinfo

代表性论文：

• [6] Runzhi Xie, Zekun Wang, Jianrui Liu, ..., Yuxuan Hu*, Lin Gao*. HRCHY-CytoCommunity identifies hierarchical tissue organization in cell-type spatial maps. Nature Communications, 2026, 17:3312.（共同通讯, IF=17, 中科院1区）[Full Text]

• [5] Runzhi Xie, Junping Li, Yuxuan Hu*, Lin Gao*. Bridging cancer cell-intrinsic driver genes and -extrinsic cell-cell communication with Driver2Comm. PLoS Computational Biology, 2026, 22:e1013973. （共同通讯, 中科院2区）[Full Text]

• [4] Han Xu, Yusen Ye, Ran Duan, Yong Gao, Yuxuan Hu*, Lin Gao*. Beaconet: A reference-free method for integrating multiple batches of single-cell transcriptomic data in original molecular space. Advanced Science, 2024, 2306770. （共同通讯, IF=15, 中科院1区）[Full Text]

• [3] Yuxuan Hu*, Jiazhen Rong, Yafei Xu, ..., Jacqueline Peng, Lin Gao, Kai Tan*. Unsupervised and supervised discovery of tissue cellular neighborhoods from cell phenotypes. Nature Methods, 2024, 21: 267-278. （唯一第一且共同通讯, IF=48, NM主页精选(Featured)文章, 中科院1区）[Full Text]

• [2] Yuxuan Hu, Tao Peng, Lin Gao, Kai Tan*. CytoTalk: De novo construction of signal transduction networks using single-cell transcriptomic data. Science Advances, 2021, 7: eabf1356. （唯一第一, IF=14, 中科院1区）[Full Text]

• [1] Yuxuan Hu, Chia-Hui Chen, Yang-Yang Ding, ..., Bingbo Wang, Lin Gao*, Kai Tan*. Optimal control nodes in disease-perturbed networks as targets for combination therapy. Nature Communications, 2019, 10: 2180. （唯一第一, IF=17, 中科院1区） [Full Text]